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Jupyter

Jupyter (旧IPython notebook)は、Notebook形式でドキュメント作成し、プログラムの記述・実行、その実行結果を記録するツールです。メモの作成や保存、共有、確認などもブラウザ上で行うことができます。

import

自身のプラットフォーム・プログラム・データセットに対して、外部ソースを取り込むプロセスをimportと呼びます。

Python 3.x

Python 3はPythonプログラミング言語の最新バージョンであり、2008年12月3日にリリースされました。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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Jupyter notebookで,モジュールがインポートできません...

JJJHHH

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Jupyter

Jupyter (旧IPython notebook)は、Notebook形式でドキュメント作成し、プログラムの記述・実行、その実行結果を記録するツールです。メモの作成や保存、共有、確認などもブラウザ上で行うことができます。

import

自身のプラットフォーム・プログラム・データセットに対して、外部ソースを取り込むプロセスをimportと呼びます。

Python 3.x

Python 3はPythonプログラミング言語の最新バージョンであり、2008年12月3日にリリースされました。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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投稿2019/02/06 11:10

編集2019/02/06 11:59

前提・実現したいこと

当方,機械学習駆け出しの身にありまして,ある方の機械学習に関するjupyter notebookを読み進めている途中です.その途中でつまずきましたので,助けていただきたいです.

発生している問題・エラーメッセージ

発生しているエラーメッセージとしては,下記のようになります.
状況としましては,教材の最初の方にインポート文があったので,それを実行しようとしたらエラーを返されました.

-------------------------------------------------- ModuleNotFoundErrorTraceback (most recent call last) <ipython-input-6-91a65986c7e9> in <module>() 2 import numpy as np 3 import numpy.random as random ----> 4 import scipy as sp 5 import pandas as pd 6 from pandas import Series, DataFrame ModuleNotFoundError: No module named 'scipy'

試したこと

試したことは以下の2つになります.
Local上のjupyter notebookで以下を打ち込みました.

!pip install numpy !pip install scipy

出力は

Collecting numpy Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/e0/b5/63b79fe426433fa1cd110eb04a94ec0c6967e56e5f57c98caf455a5fb6e2/numpy-1.16.1-cp27-cp27mu-manylinux1_x86_64.whl Installing collected packages: numpy Successfully installed numpy-1.16.1 Collecting scipy Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/45/d1/7c2b33a5daee3d67752d043fe7e1476c4465788b0b6e59367fd71fdf684a/scipy-1.2.0-cp27-cp27mu-manylinux1_x86_64.whl Collecting numpy>=1.8.2 (from scipy) Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/e0/b5/63b79fe426433fa1cd110eb04a94ec0c6967e56e5f57c98caf455a5fb6e2/numpy-1.16.1-cp27-cp27mu-manylinux1_x86_64.whl Installing collected packages: numpy, scipy Successfully installed numpy-1.16.1 scipy-1.2.0

端末でも同様のことをし,出力は同じでした.
また,以下のようにPATHの確認もしました.

import numpy as np import numpy.random as random import sys          #PATHの確認 import pprint        #PATHの確認 pprint.pprint(sys.path)  #PATHの確認 import scipy as sp import pandas as pd from pandas import Series, DataFrame

そうすると出力は以下のようになりました.

['', '/usr/lib/python36.zip', '/usr/lib/python3.6', '/usr/lib/python3.6/lib-dynload', '/home/username/.local/lib/python3.6/site-packages', '/usr/local/lib/python3.6/dist-packages', '/usr/lib/python3/dist-packages', '/usr/lib/python3/dist-packages/IPython/extensions', '/home/username/.ipython']

ただ,PATHは確認したものの,そもそもPATHの初歩的なことがわからなく,
恐る恐る質問をしてみました...
それとも,パッケージの依存関係がおかしいのであればお手上げ状態なので,いずれにせよ助言をいただきたいです...

追記

pip list

をターミナル上で実行するとscipy(1.2.0),matplotlib(2.2.3)が入っていましたが,
scipy,matplotlibどちらもモジュールインポートできませんでした.

考えられることとして,scipyがFortranコンパイラが必要だったので,インストールしてみましたが結果に変わりはありませんでしたし,おそらくmatplotlib,seabornもインポートできないです.

補足情報(状況)

状況としましては,jupyter notebookはローカルで開いており,IPythonの方から開いてると思われます.しかしながら,だいぶ前にinstallしたAnaconda3もあり,依存関係も起因しているのではと思います.また以前にPython2.7もインストールしてたので,残っています.

変なことをしたかと言われますと,最近,nbextensionをjupyter notebookに入れたことと,Anacondaの仮想環境でやらずに,localでIpythonでjupyter notebookを走らせていることでしょうか.

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tiitoi

2019/02/06 11:15

もう一度、以下のようにすると !pip install scipy Requirement already satisfied: scipy in <パス> と表示されると思うので、このパスが質問欄に書いてある sys.path の結果に含まれてるかどうか確認してみてください
JJJHHH

2019/02/06 11:29

拝見していただきありがとうございます. jupyter notebookで実行すると, ``` Collecting scipy Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/45/d1/7c2b33a5daee3d67752d043fe7e1476c4465788b0b6e59367fd71fdf684a/scipy-1.2.0-cp27-cp27mu-manylinux1_x86_64.whl Collecting numpy>=1.8.2 (from scipy) Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/e0/b5/63b79fe426433fa1cd110eb04a94ec0c6967e56e5f57c98caf455a5fb6e2/numpy-1.16.1-cp27-cp27mu-manylinux1_x86_64.whl Installing collected packages: numpy, scipy Successfully installed numpy-1.16.1 scipy-1.2.0 ``` また端末で実行しても,同様のエラーが返ってき,目的のRequirement already satisfied: scipy in <パス> が表示されませんでした...
tiitoi

2019/02/06 11:35

すでにインストール済みであれば、Requirement already satisfied と出るはずなので、何回やってもそのメッセージがでないというのは妙な気がします。 とりあえず pip コマンドはコンソール上で実行してみてはどうでしょうか
JJJHHH

2019/02/06 11:44

かしこまりました.ターミナルのことですよね? ターミナル上でpip listで実行すると, scipy(1.2.0)が入っておりました.
tiitoi

2019/02/06 14:16

> scipy(1.2.0)が入っておりました. pip list でインストールされているのが確認できたのであれば、 $ pip show scipy で表示される項目に Location: <インストール場所> の記載があると思います。これが sys.path の結果に含まれてる場所かどうかですね
JJJHHH

2019/02/06 15:14

$ pip show scipy で確認してみた所, Location:Location: /home/usrname/.local/lib/python2.7/ となり,Python2.7の方に位置していました! これをPython3のほうにするのでしょうが,やり方がやはりわからないので,教えていただけると幸いです...
tiitoi

2019/02/06 15:55 編集

OS は Linux ですかね 見たところ、システムの Python 3 で notebook を動かしているのでしょうか? その場合、pip3 コマンドという python3 環境用の pip があります。 これを使って pip3 install scipy とインストールできます。 ない場合、apt-get で入れられます。 apt-get install python3-pip もし、Notebook を動かしているのがシステムに入っている python3 でない場合、また話が変わってきますので、notebook を動かしている環境がどこなのか確定させてください
JJJHHH

2019/02/07 01:58

無事にインストール完了することができました. ありがとうございます!
guest

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自己解決

2つのPythonを有していたため,モジュールがPython2のほうに行ってしまったためにモジュールのインポートができないことがわかりました.

原因追求として,tiitoiさんに教えていただいた,
pip show <module name> (今回はscipy)をターミナル上で実行すると,
Location:Location: /home/usrname/.local/lib/python2.7/となりました.
インポートしたいモジュールがPython2.7のほうにあるために,Python3でJupyter notebookを実行すると,モジュールのインポートに失敗してしまいます.

そこで,pip installではpython2の方に自動でいってしまうため,
pip3 install <module>を叩くことで解決しました.

投稿2019/02/08 15:41

編集2019/02/08 15:43
JJJHHH

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