また分ける際には作成日時で分けるのが一般的なのでしょうか?
既にコメントがありますが、何かしら見聞きしたものであれば、出展を明記し、そうでなければご自身の考えを明記してください。
で、これについてですが、設計次第です。
ファイル管理の方法はサービスやアプリケーションによって違います。
さらにそのなかでも用途によっても違います。
例えば「記事に添付する画像」であればその記事の日付、と思うかもしれませんが、同じ日に記事を書くことができる仕様なのであれば日付は無意味ですし、ユーザーが複数いるのであれば識別する必要があります。
それをディレクトリでわけるのかファイル名でわけるのかはこれも仕様次第です。
ユーザーのプロフィール写真であれば日付は不要かもしれませんが、もし履歴を残すのであれば日時分秒まで必要かもしれません。
よって設計次第。
「これがベスト」「こうしておけば間違いない」ということはありません。
なぜなら画像であればリクエストに応じた画像が間違いなく利用、表示され、更新や削除ができれば良いわけです。
これはPCのファイル管理にも似ています。
デスクトップが汚い人もいますが、必要なときに必要なファイルを開けるのであれば何も問題はないわけです。
そりゃ情報へのアクセスは早ければ早いに越したことはありませんが、全てに同じ考え方は適用できませんよね。モノ次第です。
結論としては考えて、決めてください。
プログラムでも同じ成果を得るのにやり方はひとつではありません。手段や手法が違っていても結果が出ていれば文句はないわけです。
ただ、この手のものは後から変更するのは至難なので、さまざまな手法を考えた上で管理するのが楽なもの、やりやすいやり方を模索した上で、ケースバイケースで決めてください。