Mac 及び VirtualBoxで導入した Linuxにおいてのデータダウンロード

Question

私は、Mac book air
及び、VirtualBoxで導入したLinux上で、Ensemblというゲノムに関するサイトからマウスに関するfastaファイルをダウンロードしようとしています。
しかし、なぜか大きいファイルをダウンロードしようとすると99%でストップしてしまいます。
ターミナル上のwgetコマンドでダウンロードしてみると、99%で一度止まった後に-cオプションで再開するとなんとかダウンロードされるのですが、解凍して開いてみると中身が全部Nという使えないファイルになっています。

原因が全くわかりません。どなたか助けて頂けないでしょうか。

Answer 1

ディスクスペースに余裕がないのではないでしょうか。ホスト（MacOS)がわでダウンロードしてからlinuxに持っていってはどうでしょう。

Comments

[castea]

ありがとうございます。

ディスクスペースには十分に空きがあるはずでして…。
ホスト側でダウンロードしようとしても99%で止まってしまいます。
分かりにくい書き方をしてしまって申し訳ありません。

[KojiDoi]

その「十分なディスクスペース」はどこにありますか？　たしかwgetはまず一時ファイルを作っていくはずなので、外付けHDDなどに大きな空きがあってもルートディレクトリに割り当てられているパーティションに十分な空きがないとうまくいかない可能性はあります。
またNばかりのファイルができるということですが、ダウンロードに失敗したからといってそういう形で「壊れる」とはちょっと考えられません。配列情報ならその中にNがたくさん入った領域が含まれていても不思議ではないと思います。本当にファイルの端から端までNしかないファイルでしたか？

[castea]

本当にありがとうございます。どのファイルを見ても、スクロールしてもNだけだったので「ダウンロードに失敗した？」と思ってしまったのですが、そんなことありませんでした。無事に利用できました。
自分の早とちりでお手を煩わせてしまって申し訳ありません。

また、真摯に対応してくださって本当にありがとうございました。