Rでの自己組織化マップ

前提・実現したいこと

R言語を利用して自己組織化マップについて勉強しているのですが、自己組織化マップ、R言語共に初心者のため表示されている図が全く理解できません。

該当のソースコード

R
1> install.packages("kohonen");library(kohonen)
2> set.seed(10)
3> gr<-somgrid(topo="hexagonal",xdim=10,ydim=7)
4> iris.som<-som(as.matrix(iris[,1:4]),gr,rlen=200)
5> plot(iris.som,type="codes")
6
7> lab.cod<-as.numeric(iris[,5])
8> plot(iris.som,type="mapping",labels=lab.cod,col=lab.cod)

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

５行目までで上記の図が表示され、後の２行で下の図が表示されました。
上は自己組織化マップされた図として理解しているのですが下の図がどういった基準でグループ分けされているのかわかりません。
irisの５列目の種類を基にしているのは、なんとなくわかるのですがどういった基準で１，２，３に振り分けられているのか教えてください。

こちらのサイトを参考にさせていただきました。リンク内容

行動規範の内容に同意します

回答1件

R
1lab.cod<-as.numeric(iris[,5])
2plot(iris.som,type="mapping",labels=lab.cod,col=lab.cod)

ご自身でコードを書かれたとおりですが lab.cod でラベル付けされています。
lab.cod はirisの5列目Speciesですね。
つまりSpeciesそのもので1, 2, 3と振り分けられています。

元のクラス分けどおりSOMで分類できてますね、という確認です。

投稿2020/07/25 05:19

aokikenichi

総合スコア2218

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質問の解決につながる回答をしましょう。サンプルコードなど、より具体的な説明があると質問者の理解の助けになります。また、読む側のことを考えた、分かりやすい文章を心がけましょう。

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