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Caffe compute_image_mean.bin(平均画像作成)実行時のエラーについて

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エラーの解決方法の模索

UbuntuのCaffeで自作した訓練データで学習を実施しようとしているのですが、
平均画像作成(compute_image_mean.bin)実行時にエラーが発生してしまいます。
以下、実行時のコマンド
./build/tools/compute_image_mean.bin --backend lmdb data/db/train.lmdb data/db/caltech_mean.binaryproto
上記のディレクトリ構成には問題ございませんでした。

発生している問題・エラーメッセージ

terminate called after throwing an instance of 'std::bad_alloc'
  what():  std::bad_alloc


↑解決済み

新たに発生していた問題・エラーメッセージ

terminate called after throwing an instance of 'std::logic_error
   what(): basic_string::_S_construct null not valid


↑未解決

試したこと

キャッシュの削除を実施は実施いたしました。
以下、キャッシュ削除後の結果

root@DL-Box:/home/dl-box# free -h
                total       used       free     shared    buffers     cached
Mem:           31G       1.2G        30G        19M       1.8M       161M
-/+ buffers/cache:       1.1G        30G
Swap:         7.6G         0B       7.6G


Topを実行し、CPU使用率とメモリ使用率を確認したのですが、
それぞれ数%で高いというわけでもありませんでした。

試したこと その2

状況が変わりました。

df -h /bootを実行したところ、
ディスクの容量の94%がUseになっておりました。
過去の学習に使用したDBを外部へ移行し、空き容量を増やすことで、
上記のエラー

terminate called after throwing an instance of 'std::bad_alloc'
  what():  std::bad_alloc


は出なくなりました。
代わりに、

terminate called after throwing an instance of 'std::logic_error
   what(): basic_string::_S_construct null not valid


が出力されました。

何か解決方法や確認すべき点をご存知の方がいらっしゃれば、
ご教示いただければと思います。

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