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ベクトル間の距離をマハラノビス距離でとり、それを応用したい

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shin_shin

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ユーザーが設定した条件(例えば、300, 25, 0.7)に近い条件をとってくるような関数を、マハラノビス距離で定義したいです。

下記は、それをユークリッド距離で定義したものになります。

def take_nearest_points(df, target_vector, nearest_points =70):
    """
    df            : Pandas Dataframe where there are 3 columns (MW, Amb.temp, FD)
    target_vector : List containing 3 values (MW, Amb.temp, FD)
    nearest_points: Number meaning how many closest nearest points taken

    """

    # Preliquistes
    array_X_inputs = df.as_matrix()
    list_euclidean_distance = []

    # Calculate Euclidean distances 
    list_euclidean_distance = [distance.euclidean(target_vector, each_input) for each_input in array_X_inputs]

    # Concat the list to the original dframe 
    df["euclidean"] = list_euclidean_distance
    df_with_euclidean_sort =  df.sort_values(["euclidean"], ascending=True)

    # Extract the top n points 
    df_top_n_points = df_with_euclidean_sort.head(nearest_points)

    return df_top_n_points

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list_euclidean_distance = [distance.euclidean(target_vector, each_input) for each_input in array_X_inputs]

内の

distance.euclidean(,)

が、2点のユークリッド距離を返す関数なので
これをマハラノビス距離を返す関数(無いなら作る)に入れ替えればいいだけです。

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