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bash

bash(Bourne-again-Shell)は sh(Bourne Shell)のインプリメンテーションに様々な機能が追加されたシェルです。LinuxやMac OS XではBashはデフォルトで導入されています。

sed

sedとは、POSIX環境のために作られたコマンドラインエディタです。sedは編集スクリプトの指示のもとに複数のファイルを編集し、標準出力にその結果を出力します。

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sedである文字列を含む行の中で、特定文字列を含む行は削除しない方法

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bash

bash(Bourne-again-Shell)は sh(Bourne Shell)のインプリメンテーションに様々な機能が追加されたシェルです。LinuxやMac OS XではBashはデフォルトで導入されています。

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投稿2018/12/10 07:44

file1

1HETATM 1 CA S1M 2HETATM 2 O HOH 3HETATM 3 O HOH 4HETATM 4 C 4JH 5HETATM 5 O HOH

このようなファイルがあり、4行目以外を削除したいです。

file2

1HETATM 4 C 4JH

そこで

bash

1sed -e "/^HETATM/d" file1 > file2

としたのですが、こうすると当然全行消えてしまいます。
HETATMを含む、かつ、4JTを含まない行を削除するように書きたいのです。
どうすれば良いのか、ご教示お願いします。
(S1Mが他の文字に変わっても対応できるようにしたいです)

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回答2

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ベストアンサー

sed -e '/^HETATM.*4JH/p' -e '/^HETATM/d'で良いと思います。

投稿2018/12/10 07:52

編集2018/12/10 07:54
otn

総合スコア84423

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otn

2018/12/10 07:58

空白で区切られたフィールドに注目すると、awkで、 awk '$1!="HETATM" || $4=="4JH"'
guest

0

S1Mが他の文字に変わってもとはどういう仕様を想定されているのでしょうか?この仕様を明確化できればほど実現できたと言えそうですが、それが難しい場合には逆に回答を提示することが困難です。
単に4JT固定でよければ、以下でも良さそうですが。
sed -n -e "/^HETATM.*4JT$/p" file1 > file2

投稿2018/12/10 07:54

t_obara

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