matplotlibインストール時に発生したエラーの対処法がわからない

Question

##現状

現在Pythonを使用して機械学習を勉強しています。

そこでヒストグラムを使用して可視化する為
import matplotlib.pyplot as plt
をしているのですが、Djangoで行なっている為モジュールが存在しないというエラーが発生しました。

なので、matplotlibをインストールしようと思い実行していたのですが、インストール中に

コンパイルを停止しました。
  error: command 'gcc' failed with exit status 1

このようなログが表示され、さらに

コンパイルを停止しました。
    error: command 'gcc' failed with exit status 1

    ----------------------------------------
Command "/bin/python -u -c "import setuptools, tokenize;__file__='/tmp/pip-install-JxgJ1K/subprocess32/setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n', '\n');f.close();exec(compile(code, __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-record-dYQhY8/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile" failed with error code 1 in /tmp/pip-install-JxgJ1K/subprocess32/

このようなエラーが表示されmatplotlibがインストールできずにいます。

##問題点

1. このエラーではどういったことを言っているのか
2. このエラーの対策はなのか

この2点になります。
どうぞよろしくお願い致します。

※わからない部分ありましたら、修正依頼等で質問して下さい。

##追記

[vagrant@local sample]$ sudo pip install matplotlib
Collecting matplotlib
  Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/59/08/04933377dc4500e3698e93f9113dc3624874e0914f4c85767ecb5b389084/matplotlib-2.2.3-cp27-cp27mu-manylinux1_x86_64.whl
Requirement already satisfied: six>=1.10 in /usr/lib/python2.7/site-packages (from matplotlib) (1.11.0)
Requirement already satisfied: python-dateutil>=2.1 in /usr/lib/python2.7/site-packages (from matplotlib) (2.7.3)
Requirement already satisfied: pytz in /usr/lib/python2.7/site-packages (from matplotlib) (2018.5)
Requirement already satisfied: kiwisolver>=1.0.1 in /usr/lib64/python2.7/site-packages (from matplotlib) (1.0.1)
Requirement already satisfied: numpy>=1.7.1 in /usr/lib64/python2.7/site-packages (from matplotlib) (1.15.2)
Requirement already satisfied: cycler>=0.10 in /usr/lib/python2.7/site-packages (from matplotlib) (0.10.0)
Requirement already satisfied: pyparsing!=2.0.4,!=2.1.2,!=2.1.6,>=2.0.1 in /usr/lib/python2.7/site-packages (from matplotlib) (2.2.2)
Requirement already satisfied: backports.functools-lru-cache in /usr/lib/python2.7/site-packages (from matplotlib) (1.5)
Collecting subprocess32 (from matplotlib)
  Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/be/2b/beeba583e9877e64db10b52a96915afc0feabf7144dcbf2a0d0ea68bf73d/subprocess32-3.5.3.tar.gz
Requirement already satisfied: setuptools in /usr/lib/python2.7/site-packages (from kiwisolver>=1.0.1->matplotlib) (40.4.3)
Building wheels for collected packages: subprocess32
  Running setup.py bdist_wheel for subprocess32 ... error
  Complete output from command /bin/python -u -c "import setuptools, tokenize;__file__='/tmp/pip-install-JxgJ1K/subprocess32/setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n', '\n');f.close();exec(compile(code, __file__, 'exec'))" bdist_wheel -d /tmp/pip-wheel-_6DKQR --python-tag cp27:
  running bdist_wheel
  running build
  running build_py
  creating build
  creating build/lib.linux-x86_64-2.7
  copying subprocess32.py -> build/lib.linux-x86_64-2.7
  running build_ext
  running build_configure
  checking for gcc... gcc
  checking whether the C compiler works... yes
  checking for C compiler default output file name... a.out
  checking for suffix of executables...
  checking whether we are cross compiling... no
  checking for suffix of object files... o
  checking whether we are using the GNU C compiler... yes
  checking whether gcc accepts -g... yes
  checking for gcc option to accept ISO C89... none needed
  checking how to run the C preprocessor... gcc -E
  checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep
  checking for egrep... /bin/grep -E
  checking for ANSI C header files... yes
  checking for sys/types.h... yes
  checking for sys/stat.h... yes
  checking for stdlib.h... yes
  checking for string.h... yes
  checking for memory.h... yes
  checking for strings.h... yes
  checking for inttypes.h... yes
  checking for stdint.h... yes
  checking for unistd.h... yes
  checking for unistd.h... (cached) yes
  checking fcntl.h usability... yes
  checking fcntl.h presence... yes
  checking for fcntl.h... yes
  checking signal.h usability... yes
  checking signal.h presence... yes
  checking for signal.h... yes
  checking sys/cdefs.h usability... yes
  checking sys/cdefs.h presence... yes
  checking for sys/cdefs.h... yes
  checking for sys/types.h... (cached) yes
  checking for sys/stat.h... (cached) yes
  checking sys/syscall.h usability... yes
  checking sys/syscall.h presence... yes
  checking for sys/syscall.h... yes
  checking for dirent.h that defines DIR... yes
  checking for library containing opendir... none required
  checking for pipe2... yes
  checking for setsid... yes
  checking whether dirfd is declared... yes
  configure: creating ./config.status
  config.status: creating _posixsubprocess_config.h
  building '_posixsubprocess32' extension
  creating build/temp.linux-x86_64-2.7
  gcc -pthread -fno-strict-aliasing -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches -m64 -mtune=generic -D_GNU_SOURCE -fPIC -fwrapv -DNDEBUG -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches -m64 -mtune=generic -D_GNU_SOURCE -fPIC -fwrapv -fPIC -I/usr/include/python2.7 -c _posixsubprocess.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/_posixsubprocess.o
  _posixsubprocess.c:16:20: 致命的エラー: Python.h: そのようなファイルやディレクトリはありません
   #include "Python.h"
                      ^
  コンパイルを停止しました。
  error: command 'gcc' failed with exit status 1
  
  ----------------------------------------
  Failed building wheel for subprocess32
  Running setup.py clean for subprocess32
Failed to build subprocess32
Installing collected packages: subprocess32, matplotlib
  Running setup.py install for subprocess32 ... error
    Complete output from command /bin/python -u -c "import setuptools, tokenize;__file__='/tmp/pip-install-JxgJ1K/subprocess32/setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n', '\n');f.close();exec(compile(code, __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-record-dYQhY8/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile:
    running install
    running build
    running build_py
    creating build
    creating build/lib.linux-x86_64-2.7
    copying subprocess32.py -> build/lib.linux-x86_64-2.7
    running build_ext
    running build_configure
     _posixsubprocess_config.h is already up to date.
    building '_posixsubprocess32' extension
    creating build/temp.linux-x86_64-2.7
    gcc -pthread -fno-strict-aliasing -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches -m64 -mtune=generic -D_GNU_SOURCE -fPIC -fwrapv -DNDEBUG -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches -m64 -mtune=generic -D_GNU_SOURCE -fPIC -fwrapv -fPIC -I/usr/include/python2.7 -c _posixsubprocess.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/_posixsubprocess.o
    _posixsubprocess.c:16:20: 致命的エラー: Python.h: そのようなファイルやディレクトリはありません
     #include "Python.h"
                        ^
    コンパイルを停止しました。
    error: command 'gcc' failed with exit status 1
    
    ----------------------------------------
Command "/bin/python -u -c "import setuptools, tokenize;__file__='/tmp/pip-install-JxgJ1K/subprocess32/setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n', '\n');f.close();exec(compile(code, __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-record-dYQhY8/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile" failed with error code 1 in /tmp/pip-install-JxgJ1K/subprocess32/

Comments

[hayataka2049]

そのメッセージの上に大量に何かが出ていると思うので、それをぜんぶコピペして掲載してください

[Tatsuo_Iriyama]

記載致しました。

[hayataka2049]

一応確認したいのですが、使いたいpythonはシステムにプリインストールされているpython2.7で間違いありませんか？

[Tatsuo_Iriyama]

はい。

Answer 1

build-essential的なものを入れてないなら、まずはこれを。

$ sudo yum groupinstall "Development Tools"

参考：CentOSのDevelopment Tools

あと、python用の開発ツールも入れてください。

$ sudo yum install python-devel

Comments

[Tatsuo_Iriyama]

回答ありがとうございます。
問題解決しました！

確認なのですが、今回の問題点はどう言った事だったのでしょうか？

[hayataka2049]

matplotlibが依存するsubprocess32のビルドでコケた
subprocess32はpythonだけでなくC言語も使って書かれていて、コンパイルにはpythonのC拡張などに関連するライブラリやヘッダファイルが必要だった
$ sudo yum install python-devel
でそれを入れた
という感じですね

[Tatsuo_Iriyama]

なるほど、理解しました！
ありがとうございました

Answer 2

C++ をコンパイルするコマンド gcc がないと言っています。
pip でモジュールをインストールする際、gcc でコンパイルをしようとしたが、アプリケーションが存在しないのでエラーになっています。

以下で gcc をインストールしてから、再度試してはどうでしょうか。

sudo apt-get install build-essential

Comments

[Tatsuo_Iriyama]

ご回答ありがとうございます。
コマンド実行しましたら、
sudo: apt-get: コマンドが見つかりません
となりました。

CentOSで開発していますので、コマンドが異なると思われます。

[tiitoi]

環境構築の質問の際は OS や Python のバージョンなどを質問欄に記載するようにしてください。
CentOS なら yum install gcc でインストールできないでしょうか？

[hayataka2049]

@tiitoiさん
gccがないということはないかと
今回は「Python.h: そのようなファイルやディレクトリはありません」が直接の原因で、python-devの類を入れていないか、入れててもインクルードパスが通ってない等の可能性が考えられます

[tiitoi]

質問をぱっと見で回答を書いてしまったので、`command not found` だと思い込んでいました。ご指摘ありがとうございます。
たしかに `command 'gcc' failed with exit status 1`なので、コンパイルのエラーですね。
ubuntu なら apt-get install -y python-dev (Python3 なら python3-dev) でヘッダー等含めて入りますが、CentOS ではどうでしょうか。

[Tatsuo_Iriyama]

回答ありがとうございます。

>環境構築の質問の際は OS や Python のバージョンなどを質問欄に記載するようにしてください。

次回以降記載しようと思います。
ありがとうございました。