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Xcodeはソフトウェア開発のための、Appleの統合開発環境です。Mac OSXに付随するかたちで配布されています。

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ターミナルでTopHatとCufflinksがbuildできない

castea

総合スコア8

MacOS(OSX)

MacOSとは、Appleの開発していたGUI(グラフィカルユーザーインターフェース)を採用したオペレーションシステム(OS)です。Macintoshと共に、市場に出てGUIの普及に大きく貢献しました。

Xcode

Xcodeはソフトウェア開発のための、Appleの統合開発環境です。Mac OSXに付随するかたちで配布されています。

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投稿2018/09/05 07:28

前提・実現したいこと

DRY解析の為に,TopHatとCufflinksをインストールして使いたい

Macportsを使って両方ともインストールはできたのですが、ファイルがbuildできないと言われる。
パソコン初心者で至らないことが多いと思いますが、助けていただけると幸いです。

発生している問題・エラーメッセージ

インストールしたTopHatとCufflinksのファイルがbuildできないと言われる。 ---> Computing dependencies for cufflinks ---> Building cufflinks Error: Failed to build cufflinks: command execution failed Error: See /opt/local/var/macports/logs/_opt_local_var_macports_sources_rsync.macports.org_macports_release_tarballs_ports_science_cufflinks/cufflinks/main.log for details. Error: Follow https://guide.macports.org/#project.tickets to report a bug. Error: Processing of port cufflinks failed :debug:build Error code: CHILDSTATUS 6313 2 :debug:build Backtrace: command execution failed :debug:build while executing :debug:build "system {*}$notty {*}$nice $fullcmdstring" :debug:build invoked from within :debug:build "command_exec build" :debug:build (procedure "portbuild::build_main" line 8) :debug:build invoked from within :debug:build "$procedure $targetname" :error:build See /opt/local/var/macports/logs/_opt_local_var_macports_sources_rsync.macports.org_macports_release_tarballs_ports_science_cufflinks/cufflinks/main.log for details.

該当のソースコード

ソースコード

試したこと

最初、xcodeがインストールされていなかったのでインストールしたのですがエラーコードは変わりませんでした。
また、bowtieなどのパッケージは入っています。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

pcのスペック macOS High Sierra
MacBook Air(13-inch,Early 2015)

MacPorts 2.5.3 for macOS.
Xcode version 9.4.1

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回答1

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ベストアンサー

http://qa.lifesciencedb.jp/

これと同じ質問のようですが、最終的にTopHatが古いから新しいのを使えということのようですが。

投稿2018/09/05 08:30

t_obara

総合スコア5488

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castea

2018/09/05 08:51

ありがとうございます 自分も最初、この方と同じようにHomebrewでインストールしようとして、対応していなかったためにパッケージングソフトをmacportsに変えました。 自分も、これに倣ってやってみたのですがインストールが終わった段階でTopHatとcufflinksの両方で「Failed to build」とエラーが出てしまいます。 そもそも、TopHatとcufflinksが古いから使えないということなのでしょうか?
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