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Python 3はPythonプログラミング言語の最新バージョンであり、2008年12月3日にリリースされました。

機械学習

機械学習は、データからパターンを自動的に発見し、そこから知能的な判断を下すためのコンピューターアルゴリズムを指します。人工知能における課題のひとつです。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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Pythonで決定木を出力したい

sirou

総合スコア13

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Python 3はPythonプログラミング言語の最新バージョンであり、2008年12月3日にリリースされました。

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機械学習は、データからパターンを自動的に発見し、そこから知能的な判断を下すためのコンピューターアルゴリズムを指します。人工知能における課題のひとつです。

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投稿2018/08/02 16:40

編集2018/08/02 16:47

Macで機械学習の勉強をしています。
IDEはpycharmを使用しています。

決定木の出力を行いたいのですが、

from sklearn.tree import export_graphviz tree=DecisionTreeClassifier(max_depth=4,random_state=0) tree.fit(x_train,y_train) export_graphviz(tree,out_file="tree.dot",class_names=["malignant","benign"], feature_names=cancer.feature_names,impurity=False,filled=True) import graphviz with open("tree.dot") as f: dot_graph=f.read() graphviz.Source(dot_graph)

参考にしている本にはここまでしか書いておらず、図が出力されません。

pydotplusなどを試したのですが、

GraphViz's executables not found

と出力されて前に進みません。
graphvizの実行ファイルが見当たらないことまではわかったのですが、ファイルが見つかってもpathの通し方がわからないので、困っています。

pydotplusの使い方、またはもっと簡単に出力できる方法があれば教えていただけると幸いです。
どうぞよろしくお願いします。

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一番簡単なのは、コマンドラインで、

Export a decision tree in DOT format.

This function generates a GraphViz representation of the decision tree, which is then written into out_file. Once exported, graphical renderings can be generated using, for example:

$ dot -Tps tree.dot -o tree.ps (PostScript format)
$ dot -Tpng tree.dot -o tree.png (PNG format)

sklearn.tree.export_graphviz — scikit-learn 0.19.2 documentation

とドキュメントに説明がある通りの操作をすることです(Graphviz(紛らわしいことにpythonモジュールのgraphvizとはまた別物)が環境に入ってなかったら、適当に入れてください。macなら$ brew install graphvizとかでいけるらしいです(未確認))。

このコマンドをsubprocess.call()あたりを使って自動で打つようにすれば、pythonプログラムの実行でpngとかが吐かれるようになります。

pythonの中だけでやるなら、

python

1with open("hogetree.dot") as f: 2 s=f.read() 3g = graphviz.Source(s, format="png") 4g.render("hogetree.png")

こんな感じでできます。どちらにせよGraphvizは入れないと動きませんけど。

参考:
API Reference — graphviz 0.8.4 documentation #source

投稿2018/08/02 16:57

hayataka2049

総合スコア30933

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