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画像からデータを抽出する方法が知りたいです。

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n-takeshi

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 前提・実現したいこと

研究で画像解析を使いたいと考えています。
python、OpenCVを使って画像からデータを抽出する方法が知りたいです。
python、OpenCVは最近使い始めたばかりです。
①細胞1つ1つを区切ること
②面積、直径を求める
③細胞の個数を求める
ことをやりたいと考えています。
できることだけでも良いので教えて欲しいです。(これは絶対無理とかも教えて欲しいです)

 発生している問題・エラーメッセージ

写真のように2値化するところまではできました。
しかし、一つ一つ明るさが異なったり、何個かがひとまとめになってしまったりしています。
また、綺麗に分けることができたら、面積や直径、個数など求めたいと思っています。

何か参考になるもの等あれば教えて欲しいです。
聞く量多くて申し訳ないですが、よろしくお願いします。

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  • yuki23

    2018/05/30 00:22

    多分、研究室に配属されたての学部生だと思いますが、まずこの研究は何が目的で、何のために画像解析をするのか理解していますか?

    キャンセル

  • n-takeshi

    2018/05/30 00:24

    目的などは理解しています!

    キャンセル

  • yuki23

    2018/05/30 00:29

    聞き方が悪かったかもしれませんが、理解しているかしていないかを聞いているのではなく、それを説明してくださいというお願いです。

    キャンセル

  • n-takeshi

    2018/05/30 00:40

    木の年輪の中からデータを抽出し、生育環境などとの相関を見るというものです。

    キャンセル

回答 1

checkベストアンサー

0

ご自分で検索されていると思いますが、下記のような考え方で処理されると思います。但し画像の調整は色々工夫しないと期待した結果に到達しません。
http://www.cellstat.net/cellcount/
findContours関数がポイントかと
また自分で写真が撮れるならその写真の撮り方を工夫することも大事です。
後処理が楽なように光学・偏光フィルタの選定、倍率など

投稿

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  • 2018/05/30 11:40

    コメントありがとうございます。
    やはり写真の撮り方も重要そうですね。
    教えていただいたWebページを参考にさせていただきます。
    ありがとうございました!

    キャンセル

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