CSVファイルのデータフレームをプロットしたい

Question

CSVファイルに格納されたデータフレームをプロットしたいのですが、以下のようなエラーが出てしまいます。
ｘ軸にindex、y軸にch0とch2をプロットしたいです。いろいろ調べては見たのですが、pandasのプロットがよくわかりませんでした。。。

Traceback (most recent call last):
File "/home/pi/5\17.py", line 14, in <module>
main()
File "/home/pi/5\17.py", line 7, in main
data.plot()
File "/usr/lib/python3/dist-packages/pandas/tools/plotting.py", line
2165, in plot_frame
plot_obj.generate()
File "/usr/lib/python3/dist-packages/pandas/tools/plotting.py", line
900, in generate
self._compute_plot_data()
File "/usr/lib/python3/dist-packages/pandas/tools/plotting.py", line
970, in _compute_plot_data
'plot'.format(numeric_data.class.name))
TypeError: Empty 'DataFrame': no numeric data to plot

コード
import csv
import matplotlib as plt
import pandas as pd

def main():
    data = pd.read_csv('myakuha.csv',index_col=0)
    data.plot()
    print(data)
    plot.show()



if __name__=='__main__':
    main()

このようなデータフレームが格納されてます。（値が０なのは気にしないでください）
ch0 ch2
0 [0] [0]
1 [0] [0]
2 [0] [0]
3 [0] [0]
4 [0] [0]
5 [0] [0]
6 [0] [0]
7 [0] [0]
8 [0] [0]
9 [0] [0]
10 [0] [0]
11 [0] [0]
12 [0] [0]
13 [0] [0]
14 [0] [0]
15 [0] [0]
16 [0] [0]
17 [0] [0]
18 [0] [0]
19 [0] [0]
20 [0] [0]
21 [0] [0]
22 [0] [0]
23 [0] [0]
24 [0] [0]
25 [0] [0]
26 [0] [0]
27 [0] [0]
28 [0] [0]
29 [0] [0]

import pandas as pd
import time
import spidev
import sys
import numpy as np
import subprocess
from threading import Thread
import csv


cond = True
data1 = 0
data2 = 0
df1 = pd.DataFrame(columns=['ch0','ch2'])#data2


def main():
    spi = spidev.SpiDev()
    spi.open(0,0)

    def f():
        global cond
        time.sleep(20)
        cond = False

    thread = Thread(target=f)
    thread.start()

    while cond:
        resp = spi.xfer2([0x68,0x00])
        data1 = ((resp[0] << 8 ) + resp[1]) & 0x3ff
        resp2 = spi.xfer([0x78,0x00])
        data2 = ((resp2[0] << 8) + resp2[1]) & 0x3ff
        global df1
        df1 = df1.append({'ch0':[data1],'ch2':[data2]},ignore_index=True)
        print (df1)
        df1.to_csv('myakuha.csv')
        #left max
        df10max = df1['ch0'].max()
        #print('left:',df10max)
        #right max
        df12max = df1['ch2'].max()
        #print('right:',df12max)
        df110max = np.array(df10max)
        df112max = np.array(df12max)


        if df10max > df12max:
            leftmax = df110max - df112max
            print ('overL:',leftmax)

        if df10max < df12max:
            rightmax = df112max - df110max
            print ('overR:',rightmax)






if __name__=='__main__':
    main()

Comments

[KSwordOfHaste]

ソースとエラーメッセージの内容が不整合に見えます。このコードを実行してこのエラーにはならないのでは？

Answer 1

データフレームがちゃんと作れていれば、

import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt

def main():
    data = pd.read_csv('myakuha.csv',index_col=0)
    data.plot()
    plt.show()

if __name__=='__main__':
    main()

これで何かが出ます。
掲載されているコードには変なところが何点かあるので、これを参考に修正してください。

• import matplotlib as pltをimport matplotlib.pyplot as pltに変更する
• plot.show()をplt.show()に変更する

---

TypeError: Empty 'DataFrame': no numeric data to plot

というエラーが出ているので、型がおかしいとか、うまく読み込めていない可能性があります。
csvの中身がわからないのでなんともいえません。csv自体を（部分的にでも良いので：最初の10行とか）サンプルに貼ってみてくれませんか。

Comments

[birem]

ch0 ch2
0 [0] [0]
1 [0] [0]
2 [0] [0]
3 [0] [0]
4 [0] [0]
5 [0] [0]
6 [0] [0]
7 [0] [0]
8 [0] [0]
9 [0] [0]
10 [0] [0]
11 [0] [0]
12 [0] [0]
13 [0] [0]

データの中身はこのようになっています。一番左はindexです

[hayataka2049]

csvの文字列がほしいです。あと、そのdataが得られているならprint(data.dtypes)の結果も追加でほしいです

[birem]

文字列はどのようにすれば見ることが出来るのでしょうか・・・？

print(data.dtypes)の結果についてですが
ch0 object
ch2 object
dtype:object
となりました。

[hayataka2049]

myakuha.csvをテキストエディタで開けば見れます

[birem]

単純にファイルをひらくと以下のような結果になりました。
,ch0,ch2
0,[0],[0]
1,[0],[0]
2,[0],[0]
3,[0],[0]
4,[0],[0]
5,[0],[0]
6,[0],[0]
7,[0],[0]
8,[0],[0]
9,[0],[0]
10,[0],[0]
11,[0],[0]
12,[0],[0]
13,[0],[0]
14,[0],[0]

[hayataka2049]

数字の両側の[]はデータ（csv）の生成段階でなくせませんか？

[birem]

pandasを使ってデータフレームをcsvに書き込んでいるのですが、どうすれば[]はなくせるのでしょうか？
df1.to_csv('myakuha.csv')という文で書き込んでいます。
また、データフレームの生成は
df1 = pd.DataFrame(columns=['ch0','ch2'])
で行っています。

[hayataka2049]

質問への追記で、データ生成のコードをぜんぶ載せてください

[hayataka2049]

恐らくリストのネストが余計に入っているのだと思いますが、どうやって作ったのかわからないと答えられません＞どうすれば[]はなくせるのでしょうか？

[birem]

修正で最後にプログラムを貼りました。動作としては、2つのデータをデータフレームにリアルタイムで格納し、csvファイルに書き込むものです。

[hayataka2049]

df1 = df1.append({'ch0':[data1],'ch2':[data2]},ignore_index=True)
を
df1 = df1.append({'ch0':data1,'ch2':data2},ignore_index=True)
にしてcsvを作ると不要な[]は消えるはずです。
そうして作ったcsvをdfとして読み込めばとりあえずint型かなにかとして読み込まれると思うので、plotできるようになると思います。

Answer 2

軽く見た感じの感想に近いのですが、DataFrameが定義されていないというエラーになっているので

df = pd.DataFrame(np.random.randn(10,4),cumsum(0),columns=['a','b','c'1,'d'],index=np.arange(0,100,10))

↑のようなpdの付け忘れではないでしょうか？

Comments

[birem]

すみません。ペーストするエラーにミスがありましたので、改めて見ていただければ嬉しいです。