Atomで空白の削除(Remove Trailing Whitespace)が効かない

Question

• Ensure Single Trailing Newline: true
• Ignore Whitespace On Current Line : false
• Ignore Whitespace Only Lines: false
• Keep Markdown Line Break Whitespace: true
• Remove Trailing Whitespace: true

このような設定にしているのですが、ファイルを保存しても空白が削除されません。

• macOS High Sierra
• version 10.13.3

です。
設定が何か間違っているのでしょうか。
ファイルの保存時に空白が削除されれば良いのですが、何か方法はないでしょうか。

Comments

[fiwa]

atomをセーフモードで起動（ターミナルから`atom --safe`）した場合でも同様に空白は削除されませんか？

[tukatter]

設定の意味としてはこのようになるけど
Ensure Single Trailing Newline (ファイルの末尾に改行を追加する)
Ignore Whitespace On Current Line (カーソル行の空白は削除しない)
Ignore Whitespace Only Lines (空行の空白は削除しない)
Keep Markdown Line Break Whitespace (Markdownの改行空白は削除しない)
Remove Trailing Whitespace (末尾の空白を削除する)

どのようなファイルを保存しようとして
どの場所の空白を削除したいのか　という情報があるといいのかもしれませんね。
変更前後の差分をとることが多いのでこの手の設定を解除することをしたい派です。

全部チェックした場合とそれぞれのチェックを外した場合でどうなのかということを
する時間があるとやってみたらいいけど　
どうしてもやる場合は文字の置き換えで対応するようにしています。