おそらくVCS(Version Control System)としてGitなどと連携している状態で、リポジトリーと不一致(=ローカル変更中?)のファイルが赤くなるのではないでしょうか。普段Git管理などしないアマチュアな自分ですが、Android Studio開発元の別のIDEであるInteliJ IDEAでGitプロジェクトを作成した際そうなったような気がしました。
「android studio 3.0 project view file color」で検索(テキトウすぎる検索ですが・・・)してみたところちょっと曖昧ですが以下のQ&Aがヒットしました。
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2017/12/06 08:12
2017/12/06 08:31